Dudas sobre mi situacion

Trabajo en una empresa con denominacion S.L.U. , en regimen general, aproximadamente en el mes de abril de 2011, me despidieron por lo que pase a cobrar el paro correspondiente, en el mes de septiembre me proponen volver a la empresa pero siendo autonomo, por supuesto que acepte, deje de cobrar el paro en octubre.
Firme una compra de acciones de la sociedad y pase a formar parte de la empresa como socio, en el mes de enero la empresa me pide que se disuelva esa venta de acciones y de nuevo firmamos en notaria, dias despues tuve un pequeño accidente y he estado de baja laboral hasta mediados de mayo, ahora me incorporo al trabajo pero la empresa va muy mal y no tenemos tranajo asi que quiero darme de baja en el regimen de autonomos y recuperar mi prestacion por desempleo, pero me dicen en la gestoria que estoy de forma ilegal ya que he perdido el estado que tenia alfirmar la venta de acciones en Enero, nadie me dijo que debia hacer y he estado cobrando estos meses la prestacion por I.T. y pagando a la seguridad social mi cuota de autonomos, entonces cual es mi situacion?, como se puede solucionar?, por favor necesito ayuda. Muchas gracias por vuestra ayuda.