Pago cuota autonomo para segunda actividad

Si ya cotizas en el Régimen de Autónomos no tienes que pagar otra cuota de autónomos. Lo que sí deberás tener en cuenta es si esta tienda online la vas a montar constituyendo una SL o como profesional independiente (autónomo). Si lo haces como profesional deberás darte de alta en Hacienda mediante el 036 o 037 indicando el código de IAE que corresponda para poder facturar, presentar tus declaraciones trimestrales de IVA, declarar tus ingresos y retenciones si las tienes en tu declaración de Hacienda... Puedes echar un vistazo a este post:
http://eccgestion.com/tramites-para-empezar-a-trabajar-como-freelance
Suerte

xose hay en su consulta una afirmación que me resulta chocante: "Estoy dado de alta como autonomo por figurar como administrador de una S.L.(...) si bien mi trabajo no es el de administrador."
Aunque no ha preguntado sobre ese tema ma atrevo a recordarle o informarle que si es el administrador de la sociedad responde de todas las actividades que realice esa sociedad incluso a título personal, frente a proveedores, Hacienda, Seguridad social etc., en caso de que se le exija esa responsabilidad no podrá eximirse por 'no trabajar como administrador', eso es un contrasentido.
En mi blog http://www.pedrohernandezabogado.com/ puede encontrar más información sobre estos temas y si prefiere una atención personal y directa, con un pequeño gasto controlado por vd., puede hacerlo llamando al teléfono, 807 520 008 (Coste de la llamada: 1,21€ por minuto desde teléfono fijo y 1,57€ por minuto desde móvil)..