baja médica como asalariada y como autónoma

Hola,
trabajo a media jornada como asalariada en una empresa y, por otra parte, trabajo como autónoma (traductora) desde casa. Debido a mi embarazo, bastante avanzado, me han dado la baja médica. Mi duda es: ¿el hecho de que no pueda desempeñar mi trabajo como asalariada por motivos de salud, me impide también trabajar como autónoma? Es decir, ¿tengo que pedir necesariamente la baja también como autónoma, aunque en realidad sí que puedo trabajar estas semanas hasta que nazca el bebé, dado que lo hago desde casa?

Gracias y saludos.
Montse