Cobro cuota de Autónomo

Inicie una sociedad en Octubre, y la cuota de autónomo de ese mes, no me la cobraron, llame a tesoreria y me dijeron que por el tema de las bonificaciones no me la cobrarian hasta diciembre.
Hasta ahi correcto, Noviembre tampoco me lo cobraron, fui a tesoreria y me dijeron que el banco lo habia devuelto, seguidamente fui al banco y me dijeron que ellos no han devuelto nada, que directamente no ha llegado. (La cuenta siempre tuvo saldo positivo suficiente para pagar) ¿Al final me tocara pagar recargo y callarme? ¿Que puedo hacer para que se entiendan entre ellos?