como se pagan los impuestos de una tienda online

Hola voy a montar una tienda online para vender en España.
quisiera saber como tengo que pagar, si por modulos o por estimacion directa, que no se muy bien que significa.
otra cosa que queria saber es que iva tengo que cobrar por vender alimentos y bebidas y como justifico dicho iva cobrado online ante Hacienda.gracias