como se pagan los impuestos de una tienda online

Hola voy a montar una tienda online para vender en España.
quisiera saber como tengo que pagar, si por modulos o por estimacion directa, que no se muy bien que significa.
otra cosa que queria saber es que iva tengo que cobrar por vender alimentos y bebidas y como justifico dicho iva cobrado online ante Hacienda.gracias

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Junta de Andalucía

Se ha recibido un incentivo de la Agencia de Innovación y Desarrollo de Andalucía IDEA, de la Junta de Andalucía, por un importe de 25.892,92 €, cofinanciado en un 80% por la Unión Europea a través del Fondo Europeo de Desarrollo Regional, FEDER para la realización del proyecto 401N1700034 / DIGITALIZACION INTEGRAL DE LOS PROCESOS DE LA EMPRESA con objetivo de "Garantizar un mejor uso de las tecnología de la información".