Factura

Buenos días,

Mi problema es que he estado trabajando como diseñadora gráfica para una empresa, pero no estoy dada de alta como autónoma. Ahora la empresa me exige estar dada de alta como autónoma y que le haga una factura y sino no me pagan el trabajo. Cuando empecé a trabajar con ellos en ningún momento me dijeron que debía estar dada de alta para cobrar. Que puedo hacer?
Muchas gracias!