Devolucion Iva Facturas Impagadas

Buenos días;
Tengo presentados dos procedimientos monitorios a una sociedad por varias facturas impagadas y por su totalidad (incluido el IVA). Tengo intención de solicitar la devolución de las cuotas de Iva en este trimestre ( estoy en plazo). Pero me surge una duda. Si consigo cobrar y me pagan todo el importe reclamado,¿ cómo se trata el importe correspondiente al IVa de cada factura, si yo he solicitado la devolución al hacer las facturas rectificativas con IVA negativo?. ¿ Tengo que modificar el monitorio ya presentado? ¿ Una vez cobrado hay que hacer facturas nuevas?.
Estoy un poco perdida. Gracias