Autónomo individual o colaborador

Buenas tardes. He estado trabajando toda la vida por cuenta ajena, tengo 40 años y mi intención es darme de alta como autónomo. Además de los trabajos como consultor independiente que me puedan salir, los primeros serán los servicios que preste a la Consultora de la que mi mujer tiene la mitad de las acciones aunque el otro socio es el administrador Único. Mi mujer ahora mismo no trabaja. La duda está en sí el alta es como autónomo individual o como autónomo colaborador y me pregunto si como el trabajo inmediato es de unos dos años de duración, si cabría la posibilidad de que me contrataran en nómina está empresa o al ser mi mujer socia capitalista, tengo que ser autónomo obligatoriamente y facturarle mi trabajo? Esta cuestión influye en la posibilidad de que pueda capitalizar el paro? Gracias de antemano