autonomos

Hola
Sí que puede hacerlo, es legal, pero debe recogerse ese pago en algún documento, lo más normal una nómina. Es decir, si por ejemplo la empresa le paga 1.000 netos y además los 250 de autónomo, la n´çomina recoge el gasto total, 1.250.
En una sociedad además, el administrador generalmente debe estar dado de alta como autónomo. Echa un vistazo a este artículo: http://bit.ly/ikmGj.
Debes darse de alta como autónomos quienes ejerzan funciones de dirección y gerencia que conlleva el desempeño del cargo de consejero o administrador, o presten otros servicios para una sociedad mercantil capitalista, a título lucrativo y de forma habitual, personal y directa, siempre que posean el control efectivo, directo o indirecto, de aquélla.
Aunque quizás ebería haberte informado antes
Saludos