Modelo 100. Base imponible o totales?

Hola,

Este año es el primero que tengo que hacer la declaración como autonomo.
Estoy en estimacion directa simplificada y R.Equivalencia
Mi duda viene por si en las casillas de la declaracion que van de la 090 a la 092 y las de la 095 a la 109, las cantidades que debo poner, son la suma de las bases imponibles de las facturas o bien, la suma de los totales de mis facturas(iva inc), tanto de ingresos como de gastos.

Muchas gracias