Amortizar crédito autónomo junto a "asalariado"

Buenos días,
Me he comprado un piso y necesito hacer unas reformas. El banco que mejor condiciones me da para pagarlas es ING en su modalidad "negocios", por lo que casi seguro las hago allí ya que tengo la cuenta Negocios y que como trabajo en casa y mi domicilio fiscal es ese, puedo aprovechar como "reforma de local".
Me surge una duda. Mi pareja, asalariada y que no consta en la cuenta, pagará lógicamente la mitad del crédito y me ayudará a amortizarla más o menos rápidamente con pagas extras, pluses y demás; eso me preocupa ya que serán entradas de dinero a mi cuenta de negocios (transferencia) que, en cierto modo, estarán "descontrolados". ¿Cómo podría controlarlos o declararlos ante Hacienda? ¿o no hace falta?

¿alguna solución?

Gracias