cambio de cuenta ajena a autónoma

Hola a todos,
Soy profesora de idiomas y quiero darme de alta como autónoma y aprovechar de la tarifa plana de la Seguridad social. El problema es que en octubre volveré a trabajar con una academia por la que trabajo desde hace mucho tiempo (y con la que he ganado el 100% de mis ingresos hasta junio 2016). Si voy a trabajar con ellos como autónoma hay algunas limitaciones dado que trabajaba con ellos por cuenta ajena?