DECLARACIÓN IVA E IRPF

Hola, soy nueva en esto y me toca ver las declaraciones de IVA e IRPF.
Quizá pueda sonar un poco obvia la consulta, pero necesito una opinión profesional.
Un autónomo que realiza Actividad económica en estimación directa simplicada y régimen general de IVA. La pregunta es: ¿a final de año en la declaración de IRPF lo que se pone en la casilla de ingresos debe coincidir con todo lo que se ha declarado en IVA repercutido? Y otra: Para la presentación del modelo 130 en los gastos generados durante el trimestre, ¿entran todos los gastos? ¿sólo entran los que tienen IVA? A ver me refiero a si los gastos de nóminas, S.S. Amortizaciones y demás gastos deducibles en IRPF, si se ponen en el modelo 130 o si ese tipo de gastos solo se ponen en la Renta.

Y a ver, la última: Se supone que cuando uno emprende un negocio es para obtener un beneficio, pero, si no es así y al final los gastos han sido mayores que los ingresos, ¿en la declaración de la renta que pasa? Hay algún problema, Hacienda dice algo, Es normal?

Quizá suenen preguntas un poco obvias, pero estoy hecha un lío.
Muchas gracias.