Baja IT

Tengo reconocida una IPT por un grave infarto que sufri el año pasado pero mi pension es pequeñisima 350€. Asi que necesito trabajar y me he dado de alta como autonomo hace MENOS DE UN MES. Tengo cotizados mas de 180 dias en los ultimos 5 años pero en el Regimen General. Mi medico de cabecera quiere darme la baja medica porque estoy teniendo problemas ya que padezco ademas una fibromialgia muy grave. Mi pregunta es: ¿ si me da de baja puedo cobrar la incapacidad ?.