Dos epigrafes

Soy arquitecto técnico y ahora estoy con una mutua alternativa a RETA pero que solo me permite trabajar como arquitecto técnico. Quiero montar un taller de manualidades, por lo que no me vale lo que tengo ahora, me tengo que dar de alta de autónomos, pero querría conservar mi actividad, por lo que entiendo tendré que dar de alta 2 epígrafes. He leído en vuestras respuestas que no tiene un coste adicional, pero me gustaría saber como hay que hacerlo a nivel diario y de declaraciones (IVA, IRPF), ¿Hay llevar la contabilidad por separado? O se puede poner todo en el mismo saco.
Muchas gracias,
Marta