Régimen Especial de Bienes Usados

Buenos días a tod@s,

Ojalá me podáis ayudar con estas dudas en cuanto a este régimen de una S.L.U que se dedica a la compra-venta de vehículos.
A ver si consigo hacerme entender...
El empresario compra coches en subastas y sus facturas de compra por un lado son adquiridos a particulares (sin IVA) y por otro a empresas (con IVA).
Tengo entendido que la regla principal para este régimen es que si compras con IVA, vendes con IVA y si compras en REBU, vendes en REBU. Teniendo esto claro, sé que las de IVA no tienen mayor problema pero en las que no, sé que el IVA se determina en función del margen de beneficio que hayan obtenido de la venta.
Pongo un ejemplo:

Compra por 1.000€ (IVA incluido) y vende por 1.600 (IVA incluido).
El beneficio son 600. De ahí, saco la base imponible: 495,87€ y el IVA 104,13€.
La pregunta principal es qué cuentas contables entran en juego: compra y venta 600 y 700 a proveedor y cliente respectivamente ??
Qué cuentas se utilizan para declarar el IVA del margen de beneficio??
Mil gracias y feliz año a todos.