nuevo autónomo en unos días

Buenos días. Os planteo mi situación, y espero que me podáis sacar de dudas, por que... tela telita...
En unos días, entraré a formar parte de la familia autónoma, ya que me han ofrecido un trabajo durante (como máximo) 2 meses, en los que debo estar dado de alta como autónomo, y solo quieren emitir una única factura, al final del mismo. Voy a darme de alta como documentalista, epígrafe 776, por lo que ya se que no entro a formar parte del pago del irpf por módulos. Os comento. Si voy a emitir una única factura de 6000 euros a mediados del mes de marzo (cuando finalicen estos dos meses... ¿cuales serían los procedimientos a seguir, si tras finalizar mi trabajo voy a cesar la actividad? esto es un lio por dios!!!