¿Es imprescindible justificar las dietas que incluyes en las facturas?

Sí, siempre debes justificar las dietas. Para ello, es necesarios que guardes los justificantes de los gastos (tickets, facturas, etc.) durante el mínimo legal de cuatro años y que los presentes en caso de ser requerido por la Agencia Tributaria.

¿Se deben aplicar impuestos a las dietas añades en la factura?

No, los gastos suplidos deben ir siempre sin IVA en la factura que emitas a tu cliente.

¿Qué problemas puedes tener con las dietas como autónomo?

Si no justificas correctamente este gasto o lo contabilizas incorrectamente es posible que recibas comprobaciones y requerimientos por parte de la Agencia Tributaria.