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Los mejores programas de nóminas: comparativa
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Los mejores programas de nóminas: comparativa

Resumen > Contratar al primer empleado es una buena noticia con letra pequeña: nóminas, seguros sociales, retenciones y registro de jornada cada mes. Un buen programa convierte ese papeleo en una rutina de minutos.
Mejores programas nóminas

Actualizado el 23 de octubre de 2026

4 minutos de lectura

Por Infoautónomos

Cuando un autónomo o una pequeña empresa contrata, aparece una obligación mensual nueva: calcular y pagar la nómina, cotizar a la Seguridad Social e ingresar las retenciones de IRPF. Un software de nóminas automatiza ese ciclo a partir del contrato y el convenio de cada persona.

En esta comparativa ves qué implica tener empleados, qué debe hacer el programa y seis opciones con su perfil ideal. Para profundizar en criterios y en otras alternativas de software de nóminas, tienes también la guía del blog de Holded.

¿Qué obligaciones tienes al contratar a tu primer empleado?

Contratar a alguien te convierte en empleador ante la Seguridad Social y en retenedor ante Hacienda. Estos son los trámites:

  1. Inscribirte como empresa en la Tesorería General de la Seguridad Social y obtener tu código de cuenta de cotización.
  2. Dar de alta al trabajador antes de que empiece a trabajar.
  3. Comunicar el contrato al Servicio Público de Empleo a través de Contrat@.
  4. Pagar la nómina cada mes, con el recibo de salarios.
  5. Liquidar los seguros sociales a través de SILTRA.
  6. Ingresar las retenciones de IRPF con el modelo 111 y presentar el resumen anual con el modelo 190.
  7. Registrar la jornada diaria de cada persona.

Los pasos 4 a 7 se repiten cada mes o cada trimestre. Ahí es donde un programa ahorra tiempo de verdad.

¿Qué debe hacer un software de nóminas?

Un buen software de nóminas cubre el ciclo completo, no solo el cálculo:

  • Aplicar el convenio que corresponde a cada trabajador.
  • Calcular la nómina, con cotizaciones y retención de IRPF.
  • Generar los ficheros de SILTRA para la Seguridad Social.
  • Preparar la remesa para pagar los sueldos desde el banco.
  • Rellenar los modelos 111 y 190.
  • Contabilizar el gasto de personal.
  • Recoger incidencias como bajas, vacaciones o cambios de jornada.

Cuantos más pasos haga solo, menos dependes de copiar datos entre programas o de reenviar correos a la gestoría.

¿Cuáles son los mejores programas de nóminas?

ProgramaPara quiénIntegración contablePrecio
HoldedAutónomos y pymes que quieren todo en una herramientaNativa5 €/empleado/mes sobre cualquier plan
Cegid NominasolPequeñas empresas y despachosCon la gama de CegidLicencia según plan
SageEmpresas y despachos que usan SageCon la gama de SageBajo presupuesto
EndaliaEmpresas medianas con área de RR. HH.Por integraciónBajo presupuesto
FactorialEquipos que externalizan el cálculoPor integraciónPor empleado
Sesame HRNegocios con turnosPor integraciónDesde 4,75 €/empleado/mes

1. Holded

Holded es la opción más completa de la lista para un autónomo o una pyme pequeña, porque la nómina vive en la misma herramienta que la facturación, la contabilidad y los impuestos. No hay que pasar nada de un programa a otro.

Con las nóminas de Holded generas todas las nóminas del mes en 5 segundos, cada una con su asiento contable. A partir de ahí:

  • Creas la remesa para pagar a todo el equipo con un clic.
  • Generas los ficheros de SILTRA para comunicar bases, retenciones y liquidar seguros sociales.
  • Los modelos 111 y 190 se autorrellenan.
  • Eliges entre convenios predefinidos o subes el tuyo en PDF.
  • Gestionas varios centros de trabajo con convenios distintos.

El Centro de Modificaciones recoge bajas, variaciones e incidencias en un solo sitio, con historial por empleado, y tu asesoría partner accede gratis para revisarlo. Si además necesitas ausencias, vacaciones y control horario, el complemento Equipo Pro cuesta 1,50 € por empleado al mes.

Un ejemplo de coste: un autónomo con dos empleados en el plan Básico de Holded paga 29 € al mes más 10 € de nóminas (2 × 5 €), 39 € al mes sin IVA, con su facturación, sus modelos de IVA e IRPF y las nóminas en la misma cuenta. Los tres primeros meses del plan van con un 50% de descuento.

Ideal para: autónomos que contratan por primera vez y pymes de hasta 50 empleados que quieren nóminas, contabilidad e impuestos conectados.

2. Cegid Nominasol

Nominasol es el programa de nóminas y seguros sociales de Cegid (antes Software Delsol), muy usado por pequeñas empresas y asesorías laborales.

Ideal para: empresas cuya gestoría laboral trabaja con productos de Cegid.

3. Sage

Sage tiene soluciones de gestión laboral para empresa y despacho, con cálculo de nóminas, seguros sociales y comunicación con los organismos, y una red amplia de partners.

Ideal para: empresas que ya llevan la contabilidad con Sage.

4. Endalia

Endalia es un proveedor español de software de RR. HH. que integra nómina, expediente del empleado, formación y portal del empleado.

Ideal para: empresas medianas con un departamento de personas propio.

5. Factorial

Factorial es una plataforma de gestión de personas que centraliza fichajes, ausencias, documentos y variables de nómina, y las conecta con la asesoría o el programa de cálculo.

Ideal para: equipos que externalizan la nómina y quieren ordenar los datos que la alimentan.

6. Sesame HR

Sesame HR empezó en el control horario y hoy suma vacaciones, turnos, reclutamiento e incidencias de nómina, desde 4,75 € por empleado al mes en pago anual.

Ideal para: negocios con turnos rotativos que necesitan un registro de jornada fino.

¿Haces las nóminas tú o tu gestoría?

Las dos opciones son válidas, y el programa te sirve en ambas. Lo que cambia es para qué lo usas.

Si las hace tu gestoría, el programa te sirve para recoger las incidencias del mes y darle acceso a los datos, sin hojas de cálculo por correo. Revisa que tu gestor pueda entrar sin coste extra.

Si las haces tú, el programa tiene que cubrir el ciclo entero: nómina, SILTRA, remesa, modelos y asiento contable. Con pocos empleados y un convenio estable, el trabajo de cada mes se reduce a revisar y confirmar.

Preguntas frecuentes sobre programas de nóminas

¿Cuál es el mejor software de nóminas para autónomos?

Holded es la opción más completa de esta comparativa para un autónomo con empleados: integra la nómina con la contabilidad, genera los ficheros de SILTRA y rellena los modelos 111 y 190, por 5 € por empleado al mes.

¿Un autónomo puede hacer las nóminas de sus empleados?

Sí. Con un programa que aplique el convenio y genere los ficheros de la Seguridad Social, puedes hacerlas tú mismo. Si prefieres delegar, tu gestoría puede trabajar sobre los mismos datos.

¿Qué es SILTRA?

Es el sistema de la Seguridad Social para comunicar las cotizaciones de los trabajadores y liquidar los seguros sociales cada mes.

¿Hay que registrar la jornada de los empleados?

Sí. Las empresas deben llevar un registro diario de la jornada de cada trabajador, con hora de inicio y de fin, y conservarlo durante cuatro años.

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