Para pymes en crecimiento con más de cinco empleados, Holded es el programa de facturación más completo del mercado español: integra facturación, contabilidad automatizada, CRM e inventario desde 14,50 euros al mes en el plan Básico y cuenta con certificación Verifactu de la AEAT en todos sus planes. Para autónomos con facturación simple, el plan Plus de Holded desde 7,50 euros al mes, Quipu (desde 14 euros al mes) o FacturaDirecta (con plan gratuito disponible) son alternativas más económicas.
A continuación, la comparativa completa de los siete mejores programas de facturación en España según el perfil de cada negocio, evaluados con los mismos criterios.
Por qué elegir bien tu programa de facturación importa más que nunca
Desde el 1 de julio de 2025, los fabricantes de software de facturación están obligados a tener sus sistemas adaptados al sistema Verifactu de la Agencia Tributaria.
Esa obligación se traslada a empresas y autónomos en dos plazos concretos: las empresas con menos de seis millones de facturación deben usar software homologado desde el 1 de enero de 2027, y los autónomos desde el 1 de julio de 2027.
Excel, Word y las plantillas de PDF descargadas de internet dejaron de ser herramientas válidas para emitir facturas. La elección del programa, por tanto, ya no es solo una cuestión de comodidad: es una decisión que afecta directamente al cumplimiento legal del negocio.
Más allá del cumplimiento, hay una segunda razón práctica para escoger con criterio. Un buen programa de facturación no solo emite documentos: concilia los movimientos del banco con las facturas, genera asientos contables automáticos, gestiona el seguimiento de cobros, calcula los impuestos trimestrales y permite compartir la información en tiempo real con la asesoría.
El tiempo que ahorra al mes compensa con creces el coste de la suscripción para cualquier autónomo o empresa con actividad regular. La cuestión no es si invertir en un software, sino cuál encaja mejor con el tamaño y la operativa del negocio.
Los criterios de evaluación utilizados en esta comparativa
Esta comparativa evalúa los siete programas más relevantes del mercado español según seis criterios objetivos.
Son los mismos que aparecen en la tabla comparativa final, sin variaciones.
- Compatibilidad con Verifactu y la Ley Antifraude vigente.
- Precio de entrada y relación calidad-precio según el plan.
- Funciones más allá de la facturación básica: contabilidad, CRM, inventario, proyectos.
- Facilidad de uso y curva de aprendizaje para perfiles no técnicos.
- Integraciones con bancos, plataformas e-commerce y herramientas externas.
- Soporte en español y calidad de la documentación.
1. Holded - Mejor para pymes en crecimiento con cinco o más empleados que necesitan gestión integral
Holded es el único software del mercado español que integra en un único panel facturación, contabilidad automatizada, CRM, inventario, proyectos y gestión de RRHH.
Para autónomos: plan Plus desde 7,50 euros al mes (un usuario, Verifactu, 250 facturas al año, conexión con un banco).
Para pymes: plan Básico desde 14,50 euros al mes (dos usuarios, cinco bancos, facturas recurrentes); plan Estándar desde 29,50 euros al mes con contabilidad automatizada completa, bancos ilimitados e informes avanzados como cuenta de pérdidas y ganancias, balance de situación y cuentas anuales. Módulo de RRHH: 1,50 euros al mes por empleado. Módulo de inventario: 25 euros al mes. Certificación Verifactu en todos los planes. Integraciones nativas con Stripe, Shopify, WooCommerce, Salesforce y más de cincuenta herramientas externas.
La curva de aprendizaje es real: si vienes de Excel o de un programa básico, los primeros días pueden resultar complejos por la cantidad de módulos disponibles. Es una plataforma 100% en la nube, por lo que sin conexión a internet no se puede trabajar. Para autónomos con cinco facturas al mes y sin necesidad de contabilidad, hay opciones más sencillas y económicas en este mismo listado.
- 5/5 para pymes de cinco o más empleados con contabilidad propia y equipo comercial.
- 3/5 para autónomos con facturación sencilla: el plan Plus (7,50 euros al mes) cubre lo básico, pero las funciones avanzadas quedan fuera del alcance.
2. Quipu - Mejor para autónomos de servicios que quieren facturar sin formación contable
Quipu es el software de facturación más conocido entre autónomos y freelancers en España.
Plan Starter desde 14 euros al mes; plan Solution a 25 euros al mes; plan completo a 49 euros al mes. Todos los planes incluyen 15 días de prueba gratuita.
Quipu genera automáticamente los modelos fiscales trimestrales (modelo 130 de pagos fraccionados, modelo 303 de IVA, modelo 111 de retenciones) y tiene compatibilidad confirmada con Verifactu. La curva de aprendizaje es mínima: en cuestión de minutos se emite la primera factura sin formación previa, lo que explica su popularidad en perfiles que arrancan.
El plan Starter no incluye conciliación bancaria: esa función empieza en el plan Solution a 25 euros al mes. Quipu no tiene módulo de inventario real ni previsión de tesorería avanzada. Para una empresa con almacén, equipo comercial o proyectos complejos, se queda corto antes de lo esperado.
- 4/5 para autónomos de servicios con facturación simple.
- 2/5 para pymes en crecimiento con múltiples áreas de gestión.
3. FacturaDirecta - Mejor por su escalonado de precios para empezar sin coste
FacturaDirecta tiene la propuesta de precio más clara del mercado: plan gratuito a 0 euros con funciones básicas; plan Básico a 10 euros al mes; plan Avanzado a 20 euros al mes; plan Total a 40 euros al mes, todos más IVA. Los planes superiores incluyen conexión bancaria, automatización a través de Zapier y contabilidad online integrada.
Compatible con Verifactu en todos los planes. La interfaz es directa y la curva de aprendizaje, baja para perfiles sin experiencia previa.
El plan gratuito tiene límite de clientes y productos. No incluye las funciones de contabilidad avanzada ni CRM que sí ofrecen competidores como Holded. No es la opción idónea si el negocio tiene equipo de varias personas o gestión de stock.
- 4/5 para autónomos con menos de veinte facturas mensuales.
- 2/5 para pymes con operativa compleja.
4. Billin (TeamSystem Facturas) - Mejor para autónomos que empiezan y quieren probar sin coste
Billin, ahora llamado oficialmente TeamSystem Facturas Billin tras la adquisición de TeamSystem, es probablemente el programa más sencillo del mercado español.
Plan básico gratuito disponible. Compatible con Verifactu. La interfaz es muy limpia, orientada específicamente a autónomos sin conocimientos contables previos. Cuenta con app móvil para facturar desde cualquier lugar sin necesidad de ordenador. Genera presupuestos, facturas y albaranes en pocos clics.
Las funciones más allá de la emisión de facturas son limitadas. No tiene contabilidad integrada real, ni CRM, ni inventario. Para un autónomo con operativa muy sencilla puede ser suficiente, pero el negocio supera rápido sus capacidades en cuanto crece o se diversifica.
- 4/5 para autónomos que empiezan y quieren probar sin coste.
- 1/5 para pymes con equipo o varias líneas de negocio.
5. Anfix - Mejor para autónomos que quieren contabilidad automática sin pagar el precio de Holded
Anfix apuesta por una idea concreta: que la facturación y la contabilidad formen parte del mismo flujo automatizado, sin intervención manual.
Desde 15 euros al mes. Genera automáticamente los asientos contables al emitir cada factura, lo que elimina la necesidad de un proceso contable separado. Compatible con Verifactu. La interfaz es más limpia que la de Holded para perfiles sin formación contable, con un flujo de trabajo orientado directamente al autónomo o pyme pequeña que quiere delegar la gestión técnica al software.
Sin módulo de inventario ni CRM real. Para pymes con equipo de ventas o gestión de stock, las funciones se quedan cortas comparadas con Holded. La gestión de proyectos también es limitada, lo que descarta a Anfix para negocios donde la rentabilidad por encargo es un indicador clave.
- 4/5 para autónomos que quieren contabilidad automática sin asumir el coste de Holded.
- 2/5 para pymes con múltiples áreas de gestión.
6. Sage 50 - Mejor para empresas medianas con contabilidad compleja y departamento financiero
Sage 50 es la opción para cuando la empresa tiene requerimientos contables avanzados que otros programas no cubren: gestión multiempresa, consolidación de balances, análisis financiero profundo y reporting personalizado.
Compatible con Verifactu y con la normativa contable española actualizada (Plan General Contable, ratios de solvencia, modelos fiscales completos). Sage 50 es el estándar entre empresas con veinte o más empleados que disponen de asesoría contable propia o de un perfil financiero dedicado en plantilla.
La curva de aprendizaje es alta. No está pensado para autónomos ni para pymes pequeñas sin un perfil contable en el equipo. El precio es difícil de justificar para empresas de menos de quince empleados, especialmente si las funciones avanzadas no se utilizan a fondo.
- 5/5 para empresas medianas con contabilidad compleja y departamento financiero.
- 2/5 para autónomos o pymes pequeñas.
7. Contasimple - Mejor para negocios muy pequeños con operativa sencilla y presupuesto ajustado
Contasimple es la opción más básica del listado: para negocios que solo necesitan emitir facturas, registrar gastos y mantener los libros en orden de cara a la asesoría.
Plan gratuito disponible con funciones esenciales. Compatible con Verifactu. Buena integración con asesores y gestores para exportar los datos fiscales en los formatos habituales (CSV, Excel). El sistema visual para indicar el estado de cada factura (pagada, pendiente, vencida) es claro y accesible para perfiles sin experiencia con software de gestión.
Sin previsión de tesorería, sin CRM, sin inventario, sin contabilidad automatizada real. Para un negocio que crece en complejidad, Contasimple es un paso intermedio, no una solución a largo plazo. Migrar después a otro programa cuando el negocio escale supondrá un cambio de herramienta con su correspondiente curva de aprendizaje.
- 4/5 para negocios muy pequeños con operativa sencilla y presupuesto ajustado.
- 1/5 para pymes en crecimiento con múltiples áreas de gestión.
Tabla comparativa: los siete programas en un vistazo
Cómo elegir bien: las tres preguntas que lo aclaran todo
No hay un programa universalmente mejor que el resto. Hay el que encaja mejor con la realidad concreta de cada negocio. Antes de decantarse por uno, conviene responder con honestidad a estas tres preguntas, en este orden.
La primera: ¿cuántas facturas se emiten al mes y con cuántos clientes se trabaja? Si son menos de diez facturas mensuales a clientes recurrentes, Billin gratuito o Contasimple cubren la normativa con coste mínimo. Si el volumen es mayor o los clientes son muy heterogéneos, hace falta algo más robusto que escale con el negocio.
La segunda: ¿quién lleva la contabilidad: tú o una gestoría externa? Si hay asesor, Anfix y Holded facilitan el trabajo compartido porque ambas partes acceden a los mismos datos en tiempo real, sin enviar archivos ni preparar exportaciones. Si la contabilidad la lleva el propio negocio, hace falta automatización contable potente: Holded desde el plan Estándar o Anfix desde el plan de entrada.
La tercera: ¿el negocio necesita gestionar algo más allá de las facturas? Si la operativa incluye inventario, proyectos, equipo comercial o ventas online, un programa de facturación pura se queda corto en pocos meses. En ese caso, la inversión en un ERP completo como Holded tiene sentido desde el primer momento, porque evita la migración futura. Cambiar de software con el negocio en marcha siempre es más costoso que elegir bien desde el principio.
